Joanikije II je bio posljednji žičko-pećki arhiepiskop i prvi patrijarh novouspostavljene Pećke patrijaršije.
Rođen je u okolini Prizrena, a o njegovom porijeklu nema mnogo istorijskih podataka. Zna se da je učestvovao u radu državnih sabora i bio veoma učen i odličan diplomata. Na dvoru srpskog kralja Stefana Dušana (1331—1355) bio je logotet, a nakon smrti arhiepiskopa Danila II (1324—1337) izabran je 3. januara 1338. godine za srpskog arhiepiskopa.
Kao arhiepiskop, Joanikije je naložio da se tadašnja prestolna crkva u Peći ukrasi ikonama i freskama.
Na praznik Cvijeti 1346. godine na državnom saboru u Skoplju Joanikije je uzdignut u zvanje patrijarha Srba i Grka, čime je Srbija dobila prvog patrijarha.
NJegove mošti počivaju u Peći, gdje je i proglašen za svetitelja.